smart-seq

服务介绍：利用SMARTscribeRT酶进行逆转录从而进一步合成扩增全长RNA，它可以覆盖完整的转录本，大幅度提高基因检出数。在表达分析的基础上，进一步实现可变剪切和SNV检测等深入研究，同时也能从单细胞水平研究细胞内的基因表达和差异。点击下载“测序服务申请表格”，按需求填写表格并发送至（zhangxinshuang@cibr.ac.cn）。

 

样本要求：

 

文库类型	组织类型	送样指南
Smart-seq	细胞	细胞量在1-500（细胞裂解液+细胞不得超过3.5ul）
	血液	抽取足够量血液加入到含有肝素钠的抗凝管中，短时间可寄送，得到血液后进行单细胞悬液的制备，按照要求分选成1-500个细胞（根据实验目的，血液用量会进行调整）
	组织	取足量的新鲜组织，短时间可寄送，得到组织后后进行单细胞悬液的制备，按照要求分选成1-500个细胞（根据实验目的组织量不等）

 

技术路线：

 

 

常见问题：

 

Q：单细胞转录组扩增时会有小片段，为什么？

可能原因如下：

1.       样本存在降解；

2.       样本中存在抑制剂，比如：胰酶、台盼蓝、高浓度的EDTA等

3.       内源性RNA酶过多；

 

Q：Smart-seq扩增的CDNA的片段大小一般在多大？

一般在2000bp左右