10X ATAC

服务介绍：10x Genomics是基于微流控技术，利用Tn5转座酶对某种特定时空下的开放染色质进行切割，并加入上百万独特的Barcode的标记单细胞，通过高通量测序绘制染色质可接近性图谱，该方法可以在单细胞水平揭示细胞核内染色质的可及性差异，为单细胞水平研究表观遗传学的分析奠定数据基础。点击下载“测序服务申请表格”，按需求填写表格并发送至（zhangxinshuang@cibr.ac.cn）。

样本要求：

文库类型	组织类型	送样指南
10X ATAC	细胞	细胞量在1×10⁷-5×10⁷，细胞活性＞90%，短时间可寄送，得到细胞悬液后进行细胞抽核，并进行文库构建
	血液	抽取足够量血液加入到含有肝素钠的抗凝管中，短时间可寄送，得到血液后马上进行细胞核的制备并进行后续的建库实验（根据实验目的，血液用量会进行调整）
	组织	取足量的新鲜组织，短时间可寄送，得到组织后马上进行细胞核的制备并进行后续的建库实验（根据实验目的组织量不等）

技术路线：

常见问题：

Q：制备单细胞悬液的要求是什么？

活率：>90%；

浓度：700-1200 cells/μL；

数目：至少1*10⁷个活细胞（检测用细胞计数仪检测）；

直径：5-30 μm；

Q:制备的细胞核悬液的要求是什么？

活性：＜5%；（台盼蓝等染色），尽量去除细胞碎片和细胞团；

完整性：显微镜下，细胞核形态完整；

浓度：700-1200 cells/μL；

数目：至少20000个细胞核（检测用细胞计数仪检测）；

Q:染色的细胞核还能做10X ATAC吗？

不能，结合DNA染料会影响细胞核内的DNA构象，导致ATAC的结果存在偏差。

服务中心

10X ATAC