ATAC

服务介绍：是一种利用高通量测序对转座酶易接近核染色质进行分析的方法，通过Tn5转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割，进而获得在该时空下基因组中活跃转录的调控序列，然后通过高通量测序技术推断染色质区域的可及性，为后续的分析提供数据基础。点击下载“测序服务申请表格”，按需求填写表格并发送至（zhangxinshuang@cibr.ac.cn）。

 

样本要求：

 

 

技术路线：

 

 

常见问题：

 

Q：ATAC-seq是否需要设置重复？

建议设置3个重复，可获得更准确的结果

 

Q：ATAC适合什么样子的样本？

ATAC-seq适用于各种有参考基因组物种的细胞或组织样品。但不同物种和样品的处理条件存在很大差异，很多物种的建库存在一定风险

 

Q：ATAC-seq研究转录因子结合位点的方法与ChIP-seq有何异同？

不同于ChIP-seq 直接获取蛋白结合位点的方法，ATAC-seq 主要是基于开放区域的模体（motif）基因序列来预测可能结合的转录因子，适用于一些缺少ChIP级抗体或难于做ChIP富集的转录因子研究